Criado em 1972, ano em que foram recebidas as primeiras crianças, o Centro de Bem Estar Infantil das Janelas Verdes foi construído no espaço onde existia uma vivenda doada por D. Hortênsia Castanheira Klein à Santa Casa da Misericórdia de Lisboa, tendo sido neste mesmo local que viveu o primeiro presidente da República Portuguesa, Manuel de Arriaga.
Em 1941, D. Hortênsia Castanheira Klein decide em testamento que o espaço seria entregue à Misericórdia de Lisboa, com o encargo de aí se fazer uma creche-escola infantil para acolher os filhos das “mulheres pobres” e que o financiamento deste equipamento seria feito através do rendimento dos seus outros ativos imobiliários.
Volvidos onze anos, em 1952, a esposa do Ministro da Presidência, D. Maria Amália Lumbrales, solicitou o imóvel para aí instalar provisoriamente as oficinas de trabalhos manuais do Instituto Condessa de Rilvas, pedido que foi recusado. Só em 1957 foi escolhido o arquiteto Manuel Alzina de Menezes, que ficou encarregue de fazer o anteprojeto da creche a instalar no imóvel.
Em 1971, é concluído com sucesso o projeto do novo edificado, sendo a loja e o piso 4 ocupados pelas duas firmas, os pisos 1 a 3 pela divisão de informática da instituição e os pisos 6 e 7 por uma creche e jardim de infância da Santa Casa, que viria a ser batizada como Centro de Bem Estar Infantil das Janelas Verdes. Assim, a 2 de julho de 1972 a creche abre finalmente as suas portas às primeiras crianças.