Em 2005, Rui Cunha aceitou o desafio de liderar a Santa Casa da Misericórdia de Lisboa, onde foi reconduzido no cargo, já em 2009. O seu mandato à frente dos destinos da instituição fica marcado pela consolidação orçamental da Santa Casa, depois de um período conturbado financeiramente.
Rui Cunha foi deputado constituinte e secretário de Estado Adjunto do Ministro do Trabalho e da Solidariedade de 1999 a 2001, e da Inserção Social entre 1995 e 1999. Natural de Lisboa, o antigo provedor foi igualmente deputado à Assembleia Constituinte (1975-1976) e deputado à Assembleia da República na I Legislatura (1978), na V Legislatura (a partir de 1989) e na VII legislatura (1995).
Ao longo da sua vida, sempre dedicada à causa pública, foi condecorado com um louvor concedido pelo Comandante do Batalhão de Caçadores 1912, no ano de 1969 e um louvor concedido pelo ministro da Saúde, no ano de 1985.
É com profundo pesar que a Santa Casa da Misericórdia de Lisboa endereça sentidas condolências à família de Rui Cunha.